Геномно-маркерная стратегия селекции

Направления исследований

Создание базы данных генотипов сои

Бионформатический анализ

Формирования фонда молекулярных маркеров сои

Валидация и верификация молекулярных маркеров сои

Описание

Полногеномное секвенирования селекционных образцов сои с последующим проведением бионформатического анализа с целью оптимизации селекционного процесса путем сокращения числа скрещиваний с помощью панели молекулярных маркеров

Формирование фонда молекулярных маркеров, подтвердивших своё функциональное назначение на основе создания широкой базы данных с последующим регулярным её обновлением и добавлением маркеров

Решаемые задачи

Актуализация модели предиктивной селекции сои на основе формирования и регулярного обновления фонда молекулярных маркеров сои для валидации и верификации и формирования стратегии селекции и отбора линий с помощью технологии генетического скрининга

Предлагаемые решения

Создание и регулярная актуализация фонда молекулярных маркеров сои на основе полногеномного секвенирования селекционных образцов сои и анализа полученных данных секвенирования NGS короткими прочтениями, включающего анализ качества секвенирования, картирования данных на геном, выявление мутаций, GWAS анализ образцов по хозяйственно-полезным признакам

Результаты

База данных генотипических признаков сои

Результаты бионформатического анализа, формирования фонда молекулярных маркеров сои для последующей их верификации и валидации

Фонд молекулярных маркеров сои

Ответственный исполнитель

Центр геномной селекции и биотехнологий

Партнёры

ООО «Пластилин», ФГБНУ ВНИИСБ